Если вы не планируете использовать графический менеджер входа в систему (gdm, kdm или xdm),
тогда измените файл общей конфигурации /etc/X11/xinit/xinitrc (для всех пользователей) или .xinitrc для каждого отдельного пользователя.
Если вы хотите испольуете стандартный xdm, который идёт в связке с Xorg,
то для замены оконного менеджера
отредактируйте /etc/rc.conf и измените строчку
XSESSION="Xsession" на XSESSION="fluxbox".